府と市をあわせて都。
別のことを書こうと思っていたのですが、その前に。
キーワード：東京市（http://d.hatena.ne.jp/keyword/%c5%ec%b5%fe%bb%d4）について、間違いがある、というわけではないのですが、気になった点をいくつか書いてみます*1。
1888(明治21)年から1943(昭和18)年まで東京(当時は東京府)に存在していた市。
1888年は市制（明治21年法律第1号）が公布された年ですが、この時点では市制はまだ施行されていない（施行は翌年4月）うえに、東京が市に指定されたのは1889年2月（内務省告示第1号）ですから、1888年の時点では東京は市ではなかったというべきでしょう。
東京市の発足時点で区が15あったというのはそのとおりですが、しかしここで挙げられている15区が発足したのは1878年（郡区町村編制法（太政官布告第17号））の頃です。「東京府の中心部を15区に分けて、東京市が設置された。」とするとその時点で区分けがされたようにとられますから、「東京府の中心部の15区を市域として、東京市が設置された。」くらいにするほうがいいかもしれません。
これらの点は、ウィキペディア：東京市（http://ja.wikipedia.org/wiki/%E6%9D%B1%E4%BA%AC%E5%B8%82）のほうが記述は正確です。
ところが、都道府県庁所在地の話題になると、ちょっと事情が変わります。
たとえば千葉県の県庁所在地が「千葉市」、栃木県の県庁所在地が「宇都宮市」だというのはそのとおりなのですが、東京都の県庁（都庁）所在地は、「東京」という記述（学校の参考書など）と、「新宿区」という記述（新宿区の見解）の２とおりがあります。それぞれの主張には根拠があり、また欠点もあります。「東京」とする記述に対しては、「23区を指しているのであれば、23区のみを管轄とする自治体は存在しない。東京都を指しているのであれば、同一のものを反復しているだけで答えになっていない。」という反論がありますし、「新宿区」とする記述に対しては、「他の道府県の県庁所在地は市なのに、なぜ市と対等ではない区が所在地となるのか。」と反論されます。
でもって、はてなのキーワード：県庁所在地（http://d.hatena.ne.jp/keyword/%B8%A9%C4%A3%BD%EA%BA%DF%C3%CF）には、脚注で
「東京」と表記されているものもある
としていますが、ウィキペディア：都道府県庁所在地（http://ja.wikipedia.org/wiki/%E9%83%BD%E9%81%93%E5%BA%9C%E7%9C%8C%E5%BA%81%E6%89%80%E5%9C%A8%E5%9C%B0）では、その点について何も触れずに新宿区を所在地としています。
「県庁所在地はどこかという問いに対して、その下部の行政単位を答えるのは当然じゃないか」と考えたのでしょうが、でしたら、同じ理由で、バチカン市国の首都に「バチカン」と答えるのに対しても反論すべきでしょう。さて、何と答えますか*2？
